SciPy ODR


ODR代表 正交距离回归 ,用于回归研究。基本线性回归通常用于通过在图上绘制最佳拟合线来估计两个变量 yx 之间的关系。

用于此的数学方法称为 最小平方 ,旨在最小化每个点的平方误差总和。这里的关键问题是如何计算每个点的误差(也称为残差)?

在一个标准的线性回归中,目的是从X值预测Y值 - 因此明智的做法是计算Y值的误差(如下图所示的灰线所示)。但是,有时考虑X和Y的误差(如下图中的红色虚线所示)更为明智。

例如 - 当你知道你对X的测量是不确定的,或者当你不想关注一个变量相对于另一个变量的错误时。

正交距离线性回归

正交距离回归(Orthogonal Distance Regression,ODR)是一种可以做到这一点的方法(在这种情况下,垂直方向意味着垂直方向 - 所以它计算垂直于线条的误差,而不仅仅是垂直方向)。

单变量回归的scipy.odr实现

以下示例演示单变量回归的scipy.odr实现。

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.odr import *
import random

# Initiate some data, giving some randomness using random.random().
x = np.array([0, 1, 2, 3, 4, 5])
y = np.array([i**2 + random.random() for i in x])

# Define a function (quadratic in our case) to fit the data with.
def linear_func(p, x):
   m, c = p
   return m*x + c

# Create a model for fitting.
linear_model = Model(linear_func)

# Create a RealData object using our initiated data from above.
data = RealData(x, y)

# Set up ODR with the model and data.
odr = ODR(data, linear_model, beta0=[0., 1.])

# Run the regression.
out = odr.run()

# Use the in-built pprint method to give us results.
out.pprint()

上述程序将生成以下输出。

Beta: [ 5.51846098 -4.25744878]
Beta Std Error: [ 0.7786442 2.33126407]

Beta Covariance: [
   [ 1.93150969 -4.82877433]
   [ -4.82877433 17.31417201
]]

Residual Variance: 0.313892697582
Inverse Condition #: 0.146618499389
Reason(s) for Halting:
   Sum of squares convergence